Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms