Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CatsperbA2RTF1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms