Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms