Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ckap5A2AGT5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap5A2AGT5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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