Protein–RNA interactions for Protein: A2AED3

Fndc7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc7A2AED3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fndc7A2AED3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms