Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp8nlA2ABX0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp8nlA2ABX0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms