Protein–RNA interactions for Protein: A2ABG4

Tbc1d16, TBC1 domain family, member 16, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d16A2ABG4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tbc1d16A2ABG4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbc1d16A2ABG4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms