Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pramef6A2A8M8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pramef6A2A8M8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pramef6A2A8M8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pramef6A2A8M8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pramef6A2A8M8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pramef6A2A8M8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pramef6A2A8M8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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