Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprfA2A8L5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms