Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prdm2A2A7B5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms