Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdc27A2A6Q5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms