Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms