Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2LB96

Trbv29, T cell receptor beta, variable 29 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv29A0A0G2LB96 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trbv29A0A0G2LB96 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trbv29A0A0G2LB96 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv29A0A0G2LB96 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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