Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Trbv30A0A0B4J1P1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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