Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
UHRF1Q96T88 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
UHRF1Q96T88 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms