Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FAM3DQ96BQ1 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms