Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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