Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRNQ16849 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms