Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLPPQ16740 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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