Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NKX1-1Q15270 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NKX1-1Q15270 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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