Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms