Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SP140Q13342 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SP140Q13342 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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