Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NME3Q13232 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms