Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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