Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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