Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXD10P28358 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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