Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LHX3Q9UBR4 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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