Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NPTX1Q15818 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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