Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SGCGQ13326 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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SGCGQ13326 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SGCGQ13326 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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