Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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PGGT1BP53609 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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