Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms