Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ZBED9Q6R2W3 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms