Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NME3Q13232 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NME3Q13232 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms