Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GDE1Q9NZC3 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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