Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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