Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.7 ms