Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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VAMP3Q15836 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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VAMP3Q15836 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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VAMP3Q15836 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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