Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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PRDM2Q13029 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PRDM2Q13029 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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