Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VGFO15240 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VGFO15240 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VGFO15240 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
VGFO15240 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VGFO15240 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VGFO15240 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VGFO15240 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
VGFO15240 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VGFO15240 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VGFO15240 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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