Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMG1Q96Q15 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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