Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCN9AQ15858 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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