Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SKIV2LQ15477 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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