Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SHHQ15465 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.55□□□□□ -2
SHHQ15465 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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