Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATRQ13535 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATRQ13535 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATRQ13535 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms