Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNTA1Q13424 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms