Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRGP23470 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRGP23470 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRGP23470 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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