Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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CDH18Q13634 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CDH18Q13634 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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