Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CUL1Q13616 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CUL1Q13616 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms