Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CBX3Q13185 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CBX3Q13185 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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