Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms